农业防治：a.因地制宜种植抗病品种，注意品种合理搭配和轮换，这是防治小麦锈病的基本措施，小麦锈病致病流行小种变化较快，同一时期的不同地区流行小种不同，因此要不断培育抗新流行小种的品种。b.调节播种期。如在陇南、陇东、川北、关中、华北等广大冬麦地区，不宜过早播种。播种越早，秋苗条锈病发生越早、越重，为当地提供了越冬菌源。因此，在保墒的前提下，应尽可能的不要早播。c.及时翻耕灭茬和中耕，消灭自生麦苗，减少菌源。d.搞好大区抗病品种合理布局，切断菌源传播路线。南方麦区雨水多，麦田湿度大，有利于锈病发展，加强开沟排水，可以减轻为害。e.合理、均匀施肥。控制氮肥用量，适当增施磷、钾肥，以防止贪青晚熟，加重锈病为害。尤其在土壤缺乏磷、钾肥的地区，增施这两种化肥，可以减轻锈病为害。f.加强测报，及时喷药控病。 

化学防治：a.药剂拌种，减少病原菌。对秋苗常年发病较重的地块，用15%粉锈宁可湿性粉剂60～100克或12.5%速保利可湿性粉剂每50千克种子用约60克拌种。务必干拌，充分搅拌均匀，严格控制药量，浓度稍大会影响出苗。b.大田防治，在秋季和早春，田间发现锈病中心，应及时喷药控制。如果病叶率达到5%、严重度在10%以下，每亩用15%粉锈宁可湿性粉剂50克或20%粉锈宁乳油每亩40毫升，或25%粉锈宁可湿性粉剂每亩30克，或12.5%速保利可湿性粉剂每亩用药15～30克，对水50～70千克喷雾，或对水10～15千克进行低容量喷雾。在病害流行年如果病叶率达25%以上，严重度超过10%，就要加大用药量，视病情严重程度，用以上药量的2～3倍浓度喷雾。常用药剂有：粉锈宁、速保利、广枯灵、3%广枯灵水剂。

注意事项：在锈病发生初期用药防治效果最好，若发生大流行情况下，除及时防治发病严重的麦田外，要对周边发病轻和不发病的麦田施药剂防治，以控制病害进一步蔓延，减轻损失。